ICDD&束蕴仪器丨探索新冠特效药,我们在行动

2020-05-12



国际衍射数据中心(ICDD)解析出一种可用于治疗新冠肺炎COVID-19的潜在药物Atazanavir的晶体结构。


随着新冠病毒的蔓延,全世界医学研究人员都在努力寻找用于治疗新冠肺炎的特效药,Atazanavir(阿扎那韦,C38 H52 N6 O7)是一种能够有效治疗SARS-CoV-2病毒的药物。相关研究表明,Atazanavir有可能对抗新冠病毒COVID-19也具有一定的疗效。2015年,ICDD-PDF数据库收录了Atazanavir粉末衍射图及二维分子式(见PDF No. 00-065-1426),并于2017年修正了该物相的F因子。



仅仅知悉药物的二维分子式,对于研究药物对抗病毒的机理,还远远不够,迫切需要解析Atazanavir的晶体结构,来深入研究该药物对抗新冠病毒的疗效显得尤为重要。最近ICDD执行主席Thomas Blanton 、PDF数据库编辑Amy Gindhart和其合作者伊利诺伊理工学院的James Kaduk基于PDF卡片数据库中出版的Atazanavir标准衍射卡片,共同解析出了室温下Atazanavir的晶体结构,为医学工作者研究新冠病毒COVID-19的治疗方案提供了巨大的帮助,极大的推进了探索Atazanavir治疗新冠病毒的可行性。

采用同步辐射的方法,收集了纯相的Atazanavir的衍射图,基于Rietveld精修理论,使用JADE(ICDD-MDI)软件对其进行了指标化,Atazanavir属于单斜晶系,空间群为P21,晶胞参数为a = 15.331, b = 5.902, c = 21.562 ?, β = 96.3°; 原胞体积为1939.3 ?3




采用密度泛函理论(Densityfunctional theoryDFT),对Atazanavir的晶体结构能量计算进而优化晶体结构,以寻求最优的晶体结构。同时结合Rietveld精修的结果,对Atazanavir晶体结构进行解析。下图为Rietveld精修和DFT理论优化的Atazanavir晶体结构的对比,相关的均方根约为0.077 ?。



进一步,解析出Atazanavir的三维结构如下图所示:





文章来源:ICDD代表徐春华国际衍射数据中心ICDD